fren
Intranet
Access
Contact
Direct access Research units

Structure, dynamics and targeting of biomolecular machines

Back

Structure gallery

Forme duplex étendue du site d'initiation de la dimérisation de l'ARN génomique du VIH-1 de sous-type A
Subtype-A HIV-1 Genomic RNA Dimerization Initiation Site extended duplex form

PDB entries: 462D, 1Y99 Reference: Ennifar E, Yusupov M, Walter P, Marquet R, Ehresmann B, Ehresmann C & Dumas P, Structure (1999)

ARNt de mammifère Lys3
Mammalian tRNA Lys,3

PDB entry: 1FIR Reference: Benas P, Bec G, Keith G, Marquet R, Ehresmann C, Ehresmann B & Dumas P, RNA (2000)

Complexe ARNr des ribosomes S15/16 S
Ribosomal S15/16 S rRNA complex

PDB entry: 1DK1 Reference: Nikulin A, Serganov A, Ennifar E, Tishchenko S, Nevskaya N, Shepard W, Portier C, Garber M, Ehresmann B, Ehresmann C, Nikonov S & Dumas P, Nature Stuct Biol (2000)

UUCG ARN tétraloop
UUCG RNA tetraloop

PDB entry: 1F7Y Reference: Ennifar E, Nikulin A, Tishchenko S, Nevskaya N, Garber M, Ehresmann B, Ehresmann C, Nikonov S & Dumas P, J Mol Biol (2000)

Sous-types A et B du VIH-1 - Initiation de la dimérisation de l'ARN génomique
Subtype-A & -B HIV-1 Genomic RNA Dimerization Initiation Site kissing-complex

PDB entries: 1K9W, 1JJM, 1JJN Reference: Ennifar E, Walter P, Ehresmann B, Ehresmann C & Dumas P, Nature Struct Biol (2001)

Complexe Ribosomal S8/S16 ARNr
Ribosomal S8/16 S rRNA complex

PDB entry: 1I6U Reference: Tishchenko S, Nikulin A, Fomenkova N, Nevskaya N, Nikonov O, Dumas P, Moine H, Ehresmann B, Ehresmann C, Piendl W, Lamzin V, Garber M & Nikonov S, J Mol Biol (2001)

Complexe ribosomal S15/ARNm (modèle 3D)
Ribosomal S15/mRNA complex (3D model)

PDB entry : 3D model Reference: Serganov A, Ennifar E, Ehresmann B & Ehresmann C, J Mol Biol (2002)

Sous-type A HIV-1 DIS ARN lié à 13 cations différents
Subtype-A HIV-1 DIS RNA bound to 13 different cations

PDB entries : 1NLC, 1O3Z, 1WVD, 1Y6S, 1Y6T, 1Y73, 1Y90, 1Y95, 2OIJ, 2OJ0 Reference : Ennifar E, Walter P & Dumas P, Nucleic Acids Res. (2003)

Anneau de processivité de E.coli lié au peptide de liaison de la polymérase IV
E.coli sliding clamp bound to the polymerase IV binding peptide

PDB entry : 1OK7 Reference: Burnouf DY, Olieric V, Wagner J, Fujii S, Reinbolt J, Fuchs RP & Dumas P, J Mol Biol (2004)

Sous-type F VIH-1 ARN génomique Dimérisation Initiation Site kissing-complex
Subtype-F HIV-1
Genomic RNA
Dimerization Initiation Site kissing-complex

PDB entries: 1Y3S, 1ZCI, 1YXP, 1Y3O Reference: Ennifar E & Dumas P, J Mol Biol (2006)

Sous-type F VIH-1 ARN génomique Dimerization Initiation Site kissing-complex lié aux antibiotiques aminoglycosidiques néamine, ribostamycine, néomycine et lividomycine
Subtype-F HIV-1
Genomic RNA
Dimerization Initiation Site kissing-complex bound to aminoglycoside antibiotics neamine, ribostamycin, neomycin and lividomycin

PDB entries: 2FCY, 2FCZ, 2FD0, 2FCX References: Ennifar E, Paillart JC, Bodlenner A, Walter P, Weibel JM, Aubertin AM, Pale P, Dumas P & Marquet R, Nucleic Acids Res (2006) Ennifar E, Paillart JC, Bernacchi S, Walter P, Pale P, Decout JL, Marquet R & Dumas P, Biochimie (2006)

Initiation de la dimérisation de l'ARN génomique du VIH-1 Complexe de baisers sur site lié à l'apramycine (modèle 3D)
HIV-1 Genomic RNA Dimerization Initiation Site kissing-complex bound to apramycin (3D model)

PDB entries: 3D model Reference: Bernacchi S, Freisz S, Maechling C, Spiess B, Marquet R, Dumas P & Ennifar E, Nucleic Acids Res (2007)

Sous-type F VIH-1 ARN génomique Site d'initiation de la dimérisation Duplex étendu non ligaturé et lié aux antibiotiques aminoglycosidiques ribostamycine, paromomycine, néomycine et lividomycine
Subtype-F HIV-1
Genomic RNA
Dimerization Initiation Site
extended duplex unliganded and bound to aminoglycoside antibiotics ribostamycin, paromomycin, neomycin and lividomycin

PDB entries: 2QEK, 3C3Z, 3C44, 3C5D, 3C7R Reference: Freisz S, Lang K, Micura R, Dumas P & Ennifar E, Angewandte Chemie (2008)

Structure du VIH-1 Transcriptase inverse liée à un inhibiteur doté d'un mécanisme d'action inédit
Structure of the HIV-1
reverse Transcriptase
bound to an inhibitor with a novel mechanism of action

PDB entries: 3ISN, 3ITH Reference : Freisz S, Bec G, Radi M, Wolff P, Crespan E, Angeli L, Dumas P, Maga G, Botta M, Ennifar E. Angew Chem Int Ed Engl. 2010