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Amélioration d’aptamères d’ARN fluorogène par évolution dirigée

Les ARN fluorogènes aptamères sont des molécules capables d’interagir spécifiquement avec de petits composés fluorogènes et d’en activer la fluorescence. Par analogie avec les protéines fluorescentes (par exemple la GFP), on peut s’attendre à ce que cette nouvelle classe de marqueurs génétiques ouvre des perspectives passionnantes en biologie, à condition que des molécules suffisamment brillantes puissent être isolées. Plusieurs aptamères fluorogènes ont été décrits, les épinards et la mangue étant les mieux caractérisés. Ces deux molécules ont été isolées par SELEX, elles ont donc été sélectionnées principalement pour leur capacité à interagir avec leur colorant fluorogène apparenté plutôt que pour leur capacité à activer la fluorescence. Grâce à notre pipeline d’évolution dirigée à très haut débit, nous avons récemment amélioré les propriétés fluorogéniques et les affinités des molécules d’épinard et de mangue et nous avons développé respectivement iSpinach et Mango II, III et IV. Ces nouvelles variantes offrent une sensibilité accrue pour la surveillance de l’expression génétique par des expériences d’imagerie de cellules vivantes.

Structure de l'iSpinach
Structure de l’iSpinach et son expression in vivo en présence de son cofacteur fluorogène (DFHBI-1T)

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