Un poste de doctorat est à pourvoir au sein de l’Unité ARN (UPR9002 du CNRS) à Strasbourg.

Les virus du Zika (ZIKV) et de la Dengue (DENV) appartenant à la famille des Flavivirus sont transmis par piqûres de moustiques infectés. Avec environ 390 millions d’infections répertoriées chaque année, DENV est considéré comme l’un des virus les plus critiques par l’Organisation Mondiale de la santé. Concernant le ZIKV, la première émergence significative a été observée en 2007 dans les îles du Pacifique Sud et plus tard au Brésil, se répandant rapidement sur le continent Américain en 2015-2016. Actuellement, aucun traitement ou vaccin efficaces n’existent contre ces virus. Dans la mesure où DENV et ZIKV se répandent chez des hôtes vertébrés et invertébrés, une stratégie efficace pour bloquer la transmission virale et la diffusion du virus serait de cibler des étapes spécifiques de la réplication virale. Le développement de nouvelles stratégies antivirales nécessite une compréhension précise des étapes clefs du cycle viral. Le génome des virus à ARN comporte des régions structurées non codantes multifonctionnelles. Les régions non traduites 5′- et 3′- (UTR) des génomes de DENV et ZIKV sont hautement conservées et sont impliquées dans la réplication virale. Les interactions ARN génomique-protéines jouent un rôle crucial dans ce cycle de réplication et dans le détournement de la machinerie cellulaire de l’hôte. Afin de développer de nouvelles stratégies antivirales, les objectifs de ce projet de thèse sont de: (i) identifier et caractériser les facteurs chez le moustique qui interagissent avec l’ARN génomique de ces virus et (ii) caractériser au niveau structural et biophysique plusieurs complexes ribonucléoprotéiques impliquant des régions non codantes du génome viral et des protéines de l’hôte moustique et nécessaires au le cycle de réplication viral. Dans ce but, des approches biophysiques intégrées (microcalorimétrie, biosenseur à puce ADN, spectrométrie UV-visible, Spectrométrie de Masse, Cryo-Microscopie Electronique, Résonance Magnétique Nucléaire et Cristallographie aux rayons X) seront utilisées. Ce projet sera également réalisé en collaboration avec l’Université du Minas Gerais au Brésil, spécialisée de longue date dans les infections des virus de la Dengue et du Zika, et fera appel à l’Insectarium de l’IBMC afin d’identifier d’éventuelles protéines de l’hôte importantes pour le cycle viral. Cette étude permettra de mieux comprendre les mécanismes de la réplication virale afin de contribuer à l’élaboration rationnelle de nouveaux antiviraux.

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Coordonnées

Dr Eric ENNIFAR
e.ennifar@ibmc-cnrs.unistra.fr

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