Structure, dynamique et ciblage des machines biomoléculaires

Contacts : Eric Ennifar, Isabelle Lebars

Collaborateurs : Joao Marques (Federal University of Minas Gerais, Brazil & CNRS UPR 9022 IBMC), Karim Majzoub (IGMM Montpellier, CNRS UMR 5535).

Les virus du Zika (ZIKV) et de la Dengue (DENV) appartenant à la famille des Flavivirus sont transmis par piqûres de moustiques infectés. Avec environ 390 millions d’infections répertoriées chaque année, DENV est considéré comme l’un des virus les plus critiques par l’Organisation Mondiale de la santé. Concernant le ZIKV, la première émergence significative a été observée en 2007 dans les îles du Pacifique Sud et plus tard au Brésil, se répandant rapidement sur le continent Américain en 2015-2016. Actuellement, aucun traitement efficace ou vaccin n’existent contre ces virus. Dans la mesure où DENV et ZIKV se répandent chez des hôtes vertébrés et invertébrés, une stratégie efficace pour bloquer la transmission virale et la diffusion du virus serait de cibler des étapes spécifiques de la réplication virale. Le développement de nouvelles stratégies antivirales nécessite une compréhension précise des étapes clefs du cycle viral. Les virus à ARN comportent souvent, au sein de leur génome, des régions structurées non codantes multifonctionnelles. Les régions non traduites 5’- et 3’- (UTR) des génomes de DENV et ZIKV sont hautement conservées et sont impliquées dans la réplication virale.

Les interactions ARN-proteines jouent un rôle crucial dans ce cycle de réplication et dans le détournement de la machinerie cellulaire de l’hôte. Afin de développer de nouvelles stratégies antivirales, nous avons pour objectifs de : (i) décrypter les interactions ARN-protéines impliquées dans le cycle de réplication et (ii) identifier et caractériser les facteurs chez le moustique qui interagissent avec l’ARN génomique de ces virus. Dans ce but, nous utilisons des approches biophysiques intégrées incluant la microcalorimétrie isothermale (ITC), la technologie « switchSENSE » basée sur l’utilisation de puces à ADN, la spectrométrie UV-visible, la Spectrométrie de Masse (MS), la Résonance Paramagnétique Electronique (RPE, en collaboration), la Cryo-Microscopie Electronique (Cryo-EM), la Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) et la Cristallographie aux rayons X.